“Смотрицький каньйон” є охоронною територiєю, сформованною степовою, кальцепетрофiльною рослиннiстю. По берегах рiчки, подлизу води, зростає прибережна водна рослиннiсть.
Степова рослиннiсть включає в себе такi асоцiацiї,як осоково-дiбровникова, сеслерiєво-перстачева. Типовi види: чебрець подiльський (Thymus podolicum L.), чебрець молдавський (Thymus moldavicus Klok.et Shost), полин австрiйський (Artemisia austriaca Jacq.), самосил гайовий (Teucrium chamaedrys L.). Тут проростають лiкарськi i рiдкiснi види: первоцвiт весняний (Primula veris L.), анемона дiбровна (Anemona nemorosa L.), горицвiт весняний (Adonis vernalis L.), зiновать бiла (Chamaecytisus albus (Haeq.) Rothm.), зiновать подiльська (Chamaecytisus podolicus (Blocki) Klaskova).
На кам’янистих урвищах зростають угрупування iз цибулi подiльської (Allium podolicum ( Aschers. et Graebn.), цибулi жовтiючої (Allium flavescens Bess.), молодила руського (Sempervivum ruthenicum Koch.), авринiї скельної (Aurinia saxatilis (L.) Desv.), очитку їдкого (Sedum acre L.). Зустрiчаються рiдкiснi види з “Червоної книги”: пiвники угорськi (Iris hungarica Waldst.), рутвиця смердюча (Thalictrum foetidum L.), ясенець бiлий (Dictamnus albus L).
Прибережно-водна рослиннiсть включає в себе види: стрiлолист стрiлолистий (Sagittaria sagittifolia L.), аiр звичайний (Acorus calamus L.), очерет звичайний (Phragmites australis (Cav.) Trin.ex. Steud.), осока (Carex L.).
У водi: ряска мала (Lemna minor L.), елодея (Elodea michx L.)
На схилах “Смотрицького каньйону” зростають невеликi групи чагарникiв i дерев: шипшина собача (Rosa canina L.), шипшина Юндзiла (Rosa jundzillii Bess.), шипшина гвоздична (Rosa caryophyllarea Bess.), глiд п’ятистовпчиковий (Crataegus pentagyna Waldst.), глiд несправжньо-кривостовпчиковий (Crataegus psevdokyrtostyla Klok.), калина гордовита (Viburnum L.), лiщина звичайна (Corylus avellana L.), дерен справжнiй (Cornus mas L.), жостiр проносний (Rhamnus cathartica L.).
Помiж дерев ( липи, клени, граб, дуб) зростають печiночниця звичайна (Hepatica nobilis Mill.), медунка м’яка (Pulmonaria mollis Wulf. ex.Hornem.), анемона дiбровна (Anemona nemorosa L.), анемона жовтецева (Anemona ranunculoides L.).
Поєднання рiзних фiтоценозiв робить цей заказник неповторним флорою i рослиннiстю.
Найбiльш цiнними є види, занесеннi до Списку рiдкiсних видiв Європи згiдно Бернської Конвенцiї 1979 року. Серед них – шиверекiя.
Шиверекiя подiльська на територiї Кам’янецького Приднiстров’я проростає в околицях мiста Кам’янця-Подiльського на схилах рiчки Смотрич, в селi Устя, бiля села Китайгород. Зустрiчається в асоцiацiях: осока низька + тимофiївка валiйська, сеслерiя Гейфлера + ковила волосиста + перстач пiщаний, ковила волосиста + костриця овеча.
Шиверекiя подiльська на даннiй територiї знаходиться в одних ценозах з такими релiктовими видами, як цибуля коса, шоломниця весняна, рутвиця гачкувата.
Останнiм часом найбiльш небезпечним для стану популяцiї є засмiчення екотопiв. Рослини засипають побутовим сміттям, заливають стичними водами (каналiзацiйнi стоки), випалюють трав’янистi покриття i згорають тодi проростки та вегетуючi i генеративнi рослини. Найтиповiшим є механiчне руйнування екотопiв: видобування вапняку, щебню, розкопування земельних дiлянок,засаджування хвойних рослин, пiд покривом яких усi степовi види гинуть. Останнi роки спостерiгається зменшення екотопу i чисельностi особин популяцiї, аце свiдчить про негайну необхiднiсть охороняти вид бiльш пильно. “Смотрицький каньйон” знаходиться в межах мiста i його охоронний статус в повнiй мiрi сьогоднi не дотримується, що видно з вищесказаного.